Bayezid Medresesi, İstanbul ilinde Bayezid külliyesinin bir parçası olarak bulunur. Bayezid Medresesinin yapımına Bayezid Camii'nin inşasının bitiminden sonra başlanmıştır. 1507'de inşaatı tamamlanan medrese 1509 zelzelesinde büyük hasar görmüş fakat İstanbul'a büyük hasar veren bu zelzeleden hemen sonra tamir edildi ve şehrin en önemli medreselerinden biri haline gelmiştir.